国库集中支付电子化系统借助于电子签章、身份认证和自动留痕等技术手段，构建了电子化安全保障体系，显著提升了资金支付的安全保障水平，也是从源头上预防和治理腐败的一项重要工作。
2020年4月实行电子化支付改革以来，三都水族自治县国库集中支付中心以保障资金支付安全为主导，以财政资金支付改革为动力，加大资金支付管理监控力度，细化财政直接支付管理，实时监控财政授权支付，进一步提高预算执行到位率。截至目前，累计办理电子支付业务27168笔，电子化支付覆盖78个一级预算单位。
通过国库集中支付系统与代理银行核心业务系统的无缝对接，进一步缩小了时间和空间的距离，大大提升财政服务水平。电子化支付有效降低了预算单位行政运行成本，提高了资金支付效率，也进一步加强了对财政资金的监管。
